一、房产证办理时间

购房合同通常不会明确规定办理房产证的时间，一般情况下开发商会在交房后1-2年办理。如果购房者急于获得房产证，可以在补充协议中约定具体办理日期，并明确赔偿责任。例如，在交房一年内未办理好房产证的情况下，开发商需要支付房价的一定比例的赔偿。此外，如果因为开发商的原因导致房产证无法办理，开发商需要承担责任并进行赔偿。

二、贷款办理问题

如果购房者在签订合同并支付了巨额首付款后无法办理贷款，是否可以退房以及责任由谁承担，这些问题需要在补充协议中提前约定好。一般而言，贷款失败的原因有三种情况：1. 开发商原因：购房者可以退房且无需承担违约责任，甚至可以要求开发商承担责任；2. 银行、政策等原因：购房者可以无责解约；3. 购房者自身原因：可以与开发商重新协商付款方式，如果购房者无法支付剩余款项，则需要承担违约责任。

三、公摊面积问题

由于公摊属于隐性面积，一些开发商只会告知业主一个笼统的数字，并在其中进行操作，导致公摊纠纷时常发生。购房者在补充协议中应明确约定公摊的具体数字，并注明公摊的位置和面积大小。特别是对于公摊变更的情况，约定得越详细，对购房者越有利。此外，赠送面积可能占用了公摊，例如顶层楼台、一楼庭院等属于全体业主共有，开发商无权赠送。

四、交房标准

对于精装修的房子，必须明确规定交房标准，具体到装修材料的品牌、型号、颜色等细节。应尽可能避免使用高级、进口等模糊词语，以防开发商偷换装修材料。此外，可以在补充协议中约定，在隐蔽工程覆盖之前，购房者有权到现场进行检验，并在确认后签字，然后再进行覆盖。

五、退房责任

根据法律规定，以下情况下购房者有权退房：面积误差超过3%；房屋存在质量瑕疵或严重质量问题；开发商单方面变更规划；银行按揭失败；开发商未获得预售许可证；开发商迟迟不交房或不办理房产证；合同无效等。在补充协议中可以详细规定，例如如果退房是由于开发商原因，开发商需要承担何种责任，并在何时内退还购房款项。

六、物业问题

补充协议应明确约定物业公司及物业费的缴纳时间和金额等细节。需要明确的是，开发商和物业公司是两个不同的法律主体。按规定，物业公司应由全体业主通过业主委员会挑选确定，但目前一般做法是开发商自行成立物业公司或选择与其有业务关系的公司。如果业主对物业公司不满意，可以在入住后通过业主大会表决更换。

七、开发商的其他承诺

开发商常常使用各种促销手段，如赠送面积、学校学位、停车位等等。有时开发商会承诺楼盘周边会有商场、医院、学校等配套设施，但在收房后，业主才发现这些承诺是虚假的，而开发商则拒绝承认曾经作出承诺。为了维护购房者的利益，补充协议中应将这些承诺明确写明，并注明违约责任。