程序：1、向县级以上人民政府土地管理部门或者乡级人民政府提出书面申请；2、双方当事人出示举证的材料和依据；3、工作人员现场调查材料和取证；4、组织双方当事人进行调解，制作书面调解书；5、调解未达成协议的，或者调节书送达前一方或者双方反悔的，土地管理部门及时提出处理意见，报人民政府处理决定。

法律依据

《中华人民共和国土地管理法》第十二条   土地的所有权和使用权的登记，依照有关不动产登记的法律、行政法规执行。   依法登记的土地的所有权和使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。

《中华人民共和国土地管理法》第十四条   土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。   单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。   当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。   在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。