解决车辆挂靠合同纠纷的方式是有约定的按约定；没有约定的协议优先；协商不成的可以申请调解；调解不成的可以向法院起诉；当事人有签订仲裁协议或仲裁条款的，可以申请仲裁机构进行仲裁。行为人也可以不申请调解，选择直接诉讼或仲裁。

法律依据

《中华人民共和国民法典》第四百七十条   合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款：   （一）当事人的姓名或者名称和住所；   （二）标的；   （三）数量；   （四）质量；   （五）价款或者报酬；   （六）履行期限、地点和方式；   （七）违约责任；   （八）解决争议的方法。   当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。

《中华人民共和国仲裁法》第二条   平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。