船舶抵押权和民用航空器抵押权的设定程序

海商法规定

根据海商法第13条规定，设定船舶抵押权的程序包括抵押权人和抵押人共同向船舶登记机关办理抵押权登记。如果未经登记，抵押权将无法对抗第三人。

民用航空法规定

根据民用航空法第十六条规定，设定民用航空器抵押权的程序包括抵押权人和抵押人共同向国务院民用航空主管部门办理抵押权登记。如果未经登记，抵押权将无法对抗第三人。

抵押物登记的要求

根据担保法第四十一条规定，当事人以财产进行抵押的情况下，应当办理抵押物登记。抵押合同自登记之日起生效。

抵押物登记的部门

根据担保法第四十二条规定，办理抵押物登记的部门如下：- 以无地上定着物的土地使用权抵押的，应向土地管理部门核发土地使用权证书的土地管理部门办理登记。- 以城市房地产或者乡(镇)、村企业的厂房等建筑物抵押的，应向县级以上地方人民政府规定的部门办理登记。- 以林木抵押的，应向县级以上林木主管部门办理登记。- 以航空器、船舶、车辆抵押的，应向运输工具的登记部门办理登记。- 以企业的设备和其他动产抵押的，应向财产所在地的工商行政管理部门办理登记。

适用特别法的问题

根据海商法和民用航空法的规定，船舶抵押权和民用航空器抵押权的设定并不以登记为生效要件。然而，根据担保法的规定，登记是抵押合同生效的必要条件。因此，在设定船舶抵押权和民用航空器抵押权时，应适用特别法即海商法和民用航空法的规定，同时遵守担保法对抵押物登记的要求。这样可以确保抵押权在法律上的有效性和对抗第三人的效力。