一、拒绝拆迁补偿协议的合法性

根据我国相关法律的规定，对于不满意城中村拆迁改造补偿的当事人，可以选择拒绝在拆迁补偿协议上签字，并且有权申请行政复议或提起行政诉讼来维护自己的利益。根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十四条的规定，被征收人对市、县级人民政府作出的房屋征收决定不服的，可以依法申请行政复议，也可以依法提起行政诉讼。此外，根据该条例第二十六条的规定，如果房屋征收部门与被征收人在征收补偿方案确定的签约期限内无法达成补偿协议，或者被征收房屋所有权人不明确的情况下，房屋征收部门可以向市、县级人民政府提请作出房屋征收决定，并在征收范围内进行公告。被征收人对补偿决定不服的，可以依法申请行政复议，也可以依法提起行政诉讼。

二、房屋拆迁补偿安置的程序和方式

1、规划管理部门核发建设用地规划许可证，并确定拆迁范围后，需通知被拆迁房屋所在地的区、县政府机关。2、区、县政府机关需通知房屋所在地的公安机关控制居民常住户口的迁入，并停止办理居民常住户口分户手续；房管部门和房屋经营单位需停止办理房屋的买卖、交换、析产、分割、赠予、分户等手续；被拆迁单位需停止建筑物、构作物的改建、扩建和装修等工程；所在地的工商行政管理部门需停止核发营业执照。3、房屋征收部门制定征收补偿方案，并报市、县级人民政府审批。市、县级人民政府应组织相关部门对征收补偿方案进行论证并公布，同时征求公众意见。征求意见期限不得少于30日。4、如果因旧城区改建需要征收房屋，多数被征收人认为征收补偿方案不符合相关法规的规定，市、县级人民政府应组织听证会，邀请被征收人和公众代表参与，并根据听证会的情况对方案进行修改。5、拆迁人与被拆迁人需签订《房屋拆迁补偿安置协议书》，明确拆迁事项的权利义务，包括补偿形式、金额、应安置人口、应安置面积、安置地点、层次、搬迁过渡形式、期限、违约责任等内容。