两个公司合并后的资质是否可以保留

根据《住房城乡建设部关于建设工程企业发生重组、合并、分立等情况资质核定有关问题的通知》的规定，对于两个公司合并后的资质保留有以下情况：

1. 企业吸收合并

在一个企业吸收另一个企业的情况下，被吸收企业已办理工商注销登记并提出资质证书注销申请，合并后的企业可以申请继承被吸收企业的资质。

2. 企业新设合并

在有资质的几家企业合并重组为一个新企业的情况下，原有企业已办理工商注销登记并提出资质证书注销申请，新企业可以申请承继原有企业的资质。

3. 企业合并(吸收合并及新设合并)

对于被吸收企业或原企业短期内无法办理工商注销登记的情况，在提出资质注销申请后，合并后的企业可以获得一定有效期的资质证书。如果在有效期内完成工商注销登记，可以按规定换发有效期为5年的资质证书；如果逾期未提出申请，其资质证书将作废，企业需要按照相关规定重新核定资质。