一、责任划分

船舶碰撞案件中，双方争议的焦点通常是财产损害赔偿和人身损害赔偿。根据我国《海商法》的规定，船舶碰撞事故赔偿制度大多遵从过错责任原则，由过错方按其过错程度对受害方进行赔偿。双方在辩论碰撞责任后，才能确定赔偿事宜。

二、损失赔偿

船舶碰撞可能给双方造成巨大的损失，包括船舶损失、货损、人身损害、沉船打捞、海难救助、船期损失等费用。确定海上碰撞的损失及损失赔偿的优先顺序成为焦点问题。

三、船舶碰撞案件中的赔偿限额和优先权

船舶碰撞案件中，赔偿限额对双方当事人具有重要意义。根据我国《海商法》规定，船舶仅以其船舶赔偿限额为限对碰撞事故承担责任。船舶优先权制度赋予特定的人优先受偿的权利，包括船员工资、人身伤亡赔偿、船舶吨税等。受损方也有减损义务，应尽力减少损失。

四、船舶保险制度和碰撞责任的保赔保险制度

船舶保险制度对被保险人因船舶碰撞而引发的法律赔偿责任具有重要保障作用。我国船舶碰撞责任险和船东互保协会的保赔范围可以承保碰撞责任，保障当事人的合法权益和赔偿能够得到更好的保护和清偿。在诉讼过程中，可以向保险公司或船舶互保协会主张赔偿款项。