农村自建房柱子歪两公分该扣多少工程款

农村自建房的柱子如果歪了两公分，扣除的工程款需要根据合同条款和当地建筑规范来确定。

以下是一些可能考虑的因素：

合同条款：如果在建房合同中有明确的质量标准和验收标准，那么应当参照合同来确定是否达标以及相应的扣款标准。
建筑规范：国家或地方的建筑规范可能会对建筑物的垂直度有明确的要求。如果柱子的偏差超出了规范的要求，可能需要进行返工或加固，并据此扣除相应的工程款。
实际影响：柱子歪斜是否影响了房屋的使用功能或安全性，如果造成了实质性的影响，可能需要扣除更多的工程款来弥补损失。
修复成本：如果需要对柱子进行矫正或加固，那么修复的成本也应当计入扣除的工程款中。
双方协商：业主和承包方可以通过协商来确定一个双方都能接受的扣款金额。
第三方评估：如果双方无法达成一致，可以请第三方权威机构进行鉴定，以确定柱子歪斜的具体影响和处理措施。