天然气表被装反，打过电话通知过燃气公司，

根据《城镇燃气管理条例》第二十八条的规定，燃气供热企业应当向用户正常、稳定、安全地供热，在供热期间应当确保居民卧室起居室的温度不低于16摄氏度。如果因设备故障或不可抗力不能正常供热的，应当及时通知用户并立即组织抢修，同时报告城市人民政府城市燃气供热主管部门。

在您的情况中，由于燃气表被装反，这可能影响了您的正常用气，且您已经通知过燃气公司，但公司迟迟未进行处理。如果因为燃气公司的延误导致了您无法正常使用燃气，那么燃气公司未能提供正常的服务，理论上不应收取这段时间的费用。

因此，建议您与燃气公司进行沟通，说明情况，并提供相应的证据，如电话通知的记录等。如果燃气公司仍然坚持收取这两年的费用，您可以根据合同条款和相关法律规定，向相关部门投诉或者寻求法律途径解决争议。