您好，甲方和总公司签的工程发包合同，工程

依据《中华人民共和国民法典》第七百零六条，保证人可以在主债权履行期限届满后，向债权人承担保证责任时，享有对债务人的追偿权。此外，保证人在承担保证责任后，除了债权人主动放弃权利外，有权在其承担保证责任的范围内向债务人追偿，享有债权人对债务人的权利，但不得损害债权人的利益。

在您的情况中，如果甲方与总公司之间的工程发包合同中没有明确约定工程款必须直接支付给总公司，且分公司作为总公司的分支机构，具有接收款项的能力和权限，那么理论上是可以的。然而，这需要满足以下条件：

分公司必须是依法设立并具备相应资质的法人或其他组织；
分公司必须有权利和能力接收工程款；
分公司接收工程款不违反任何法律法规或合同约定。
在实践中，为了确保合同的顺利履行和避免潜在的法律风险，建议在签订合同时就明确约定款项的支付对象。如果合同中已经约定了款项应支付给总公司，而甲方希望将款项支付给分公司，最好的做法是修改合同条款，或者取得总公司的书面同意，以免产生不必要的纠纷。

因此，如果您是甲方并且希望将工程款支付给分公司，应当首先检查合同条款，确认是否有相关的规定。如果没有，应当与总公司协商，取得其同意，并可能需要对合同进行相应的修改。