我们小区的别墅都是统一的二层式样，但是有

根据《中华人民共和国物权法》第八十九条规定，不动产权利人不得违反国家规定弃置固体废物，排放大气污染物、水污染物、噪声、光、电磁波辐射等有害物质。如果您的东邻居在装修过程中违反了相关规定，将屋面拆除并重建为三层，可能涉嫌违法。

建议您先与您的东邻居沟通，了解他们的装修情况是否符合相关规定。如果确实存在违法行为，您可以向当地的物业管理部门或者城市规划部门进行举报。同时，您也可以咨询专业的律师，了解具体的法律依据和解决方案。

在此过程中，请注意保护自己的合法权益，遵守法律法规，尊重邻里关系。