一、保险公司按用药类别赔付医疗费是否合法

根据《中华人民共和国道路交通安全法》第76条的规定，保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内应当全额赔偿机动车发生交通事故造成的人身伤亡和财产损失。对于医疗费用的赔付，保险公司不得按照用药类别进行限制，也就是说，保险公司不可以根据患者所使用的药物类别来决定医疗费用的赔付金额。因此，保险公司按用药类别赔付医疗费是不合法的。

二、法律规定

根据《中华人民共和国道路交通安全法》第76条的规定，保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内应当全额赔付机动车发生交通事故造成的医疗费用。如果保险公司的赔付金额不足以支付全部医疗费用，那么根据该条规定，保险公司应当承担不足部分的赔偿责任。具体来说，如果机动车之间发生交通事故，有过错的一方应当承担赔偿责任；如果双方都有过错，那么根据各自过错的比例来分担责任。因此，根据法律规定，保险公司应当全额赔付医疗费用，并且不得按照用药类别进行限制。如果保险公司不全额赔付医疗费用，那么其行为是不合法的。