依据相关法律规定，生态环境损害赔偿协议的司法确认是必要的

根据我国法律的规定，当环境保护部门与污染人就生态环境损害赔偿达成协议时，当事人有权向人民法院申请司法确认。为了保障协议的有效性和公正性，人民法院在受理申请后会对协议内容进行公告。

司法确认程序的具体要求

根据《最高人民法院关于审理生态环境损害赔偿案件的若干规定(试行)》，当事人经过磋商达成生态环境损害赔偿协议后，可以向人民法院申请司法确认。一旦人民法院受理了申请，就会公告协议内容，公告期间不少于三十日。公告期满后，人民法院会对协议内容进行审查，确认协议的有效性。在裁定书中，人民法院会明确案件的基本事实和协议内容，并向社会公开。

拒绝履行协议的后果

如果一方当事人拒绝履行协议或未完全履行，无论是在法律效力发生之前还是经过司法确认后，对方当事人可以向人民法院申请强制执行。如果需要修复生态环境，省级、市地级人民政府及其指定的相关部门、机构会依法组织实施修复工作。

生态环境损害赔偿方案的适用范围

适用范围的明确规定

根据《方案》的规定，生态环境损害赔偿方案适用于以下情况：1. 发生较大及以上突发环境事件的情况；2. 在国家和省级主体功能区规划中划定的重点生态功能区、禁止开发区发生环境污染、生态破坏事件的情况；3. 发生其他严重影响生态环境后果的情况。各地区应根据具体情况，综合考虑造成的环境污染、生态破坏程度以及社会影响等因素，明确具体情形。

不适用本方案的情况

本方案不适用于以下情况：1. 涉及人身伤害、个人和集体财产损失要求赔偿的情况，适用侵权责任法等法律规定；2. 涉及海洋生态环境损害赔偿的情况，适用海洋环境保护法等法律及相关规定。