立案后证据不足的，如果案件在侦查阶段，则公安机关应在侦查期限届满后撤销案件，释放犯罪嫌疑人；如果案件在起诉阶段，则检察机关在二次补充侦查后，应作出不起诉的决定；如果案件在审判阶段，则人民法院应作出无罪判决。

法律依据

《《中华人民共和国刑事诉讼法》》第一百六十三条   在侦查过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，应当撤销案件；犯罪嫌疑人已被逮捕的，应当立即释放，发给释放证明，并且通知原批准逮捕的人民检察院。

《《中华人民共和国刑事诉讼法》》第一百七十五条   对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。

《《中华人民共和国刑事诉讼法》》第二百条   在被告人最后陈述后，审判长宣布休庭，合议庭进行评议，根据已经查明的事实、证据和有关的法律规定，分别作出以下判决：   （二）依据法律认定被告人无罪的，应当作出无罪判决；   （三）证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。