一、公司合并的程序

制定合并方案

根据《公司法》第四十六条规定，董事会负责制定公司合并、分立、变更公司形式、解散的方案，以履行对股东会的职责。

股东会做出公司合并决议

根据《公司法》第四十三条规定，公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经过代表三分之二以上表决权的股东通过。

各方签订合并协议

根据《公司法》第一百七十三条规定，公司合并应当由合并各方签订合并协议。根据《最高人民法院关于审理与企业改制相关的民事纠纷案件若干问题的规定》第三十条规定，企业合并协议在当事人签字盖章之日起生效。如果需要政府主管部门的批准，合并协议在批准之日起生效；如果未经批准，合并协议不生效。但是，如果当事人在一审法庭辩论终结前补办报批手续，人民法院应当确认该合并协议有效。

编制公司资产负债表及财产清单

根据《公司法》第一百七十三条规定，公司合并时，合并各方应当签订合并协议，并编制资产负债表及财产清单。

通知债权人并进行公告

根据《公司法》第一百七十三条规定，公司应当自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并在三十日内在报纸上进行公告。债权人自接到通知书之日起三十日内，或者自公告之日起四十五日内（如果未接到通知书），可以要求公司清偿债务或者提供相应的担保。

办理注销、变更、设立登记

根据《公司登记管理条例》第三十八条规定，因合并、分立而存续的公司，如果登记事项发生变化，应当申请变更登记；因合并、分立而解散的公司，应当申请注销登记；因合并、分立而新设立的公司，应当申请设立登记。

二、公司合并后的债权债务处理

根据《公司法》第一百七十四条规定，公司合并时，合并各方的债权、债务应当由合并后的存续公司或者新设的公司承继。根据《合同法》第九十条规定，当事人订立合同后合并的，合并后的法人或者其他组织行使合同权利，履行合同义务。当事人订立合同后分立的，除非债权人和债务人另有约定，分立的法人或者其他组织享有连带债权，承担连带债务。根据《最高人民法院关于审理与企业改制相关的民事纠纷案件若干问题的规定》的规定如下：- 第三十一条：企业吸收合并后，被兼并企业的债务由兼并方承担。- 第三十二条：企业进行吸收合并时，应当根据公司法的相关规定，公告通知债权人。企业吸收合并后，如果债权人对被兼并企业原资产管理人（出资人）隐瞒或者遗漏的债务提起诉讼，债权人在公告期内申报过该债权的情况下，兼并方在承担民事责任后可以向被兼并企业原资产管理人（出资人）追偿。如果债权人在公告期内未申报过该债权，则兼并方不承担民事责任。人民法院可以告知债权人另行起诉被兼并企业原资产管理人（出资人）。- 第三十三条：企业新设合并后，被兼并企业的债务由新设合并后的企业法人承担。- 第三十四条：企业吸收合并或新设合并后，如果被兼并企业未办理工商注销登记而债权人对其提起诉讼，人民法院应当根据企业合并后的具体情况，告知债权人追加责任主体，并判令责任主体承担民事责任。