全家迁入设区的市转为非农业户口的承包地处理方式

根据《中华人民共和国农村土地承包法》的规定，如果承包方全家迁入设区的市并转为非农业户口，那么应当将承包的耕地和草地交回发包方。如果承包方不交回，发包方有权收回承包的耕地和草地。

合户经营的承包地确权登记颁证方式

根据《中华人民共和国农村土地承包法》和《农村承包经营权证管理办法》的相关规定，对于以前已经与发包方重新签订承包合同并进行了承包土地经营权变更合户经营的承包地，可以进行确权登记颁证。如果存在争议并且没有完备手续的情况，当事人应先依法解决争议后才能进行确权登记颁证。

处理原颁发的土地承包经营权证书

根据《农村土地承包经营权证管理办法》和《农业部办公厅关于印发《农村土地经营权登记试点工作规程(试行)》的通知》的规定，这次承包地确权登记办证工作将颁发农业部统一格式的土地承包经营权证书。

新颁发的土地承包经营权证书的费用承担方

根据2013年中央、省委1号文件和农业部《关于开展农村土地承包经营权登记试点工作的意见》的规定，新颁发的土地承包经营权证书及相关费用由各级政府列入财政预算，不得向农户收取。