商铺租赁合同纠纷可以采取协商、调解、仲裁、诉讼方式处理。当事人可以沟通协商达成一致，也可以请求有关部门进行调解，或者依法申请仲裁、提起诉讼。因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。

法律依据

《《中华人民共和国民法典》》第十条   【法律适用】处理民事纠纷，应当依照法律；法律没有规定的，可以适用习惯，但是不得违背公序良俗。