总公司和分公司的管辖约定

根据合同协议管辖优先的原则

根据《民事诉讼法》的相关规定，合同协议管辖优先。因此，当总公司和分公司之间在合同中约定了法院的管辖权，只要双方同意且不违反相关规定，双方可以选择不以约定的法院管辖。

民事诉讼案件的法院管辖限制

民事诉讼案件不能自由约定选择法定管辖以外的法院来管辖。然而，对于仲裁案件而言，双方可以自由意愿约定选择仲裁委员会进行仲裁，不受法定管辖的限制。

分公司所在地法院的优先管辖权

如果实际业务发生在被告的分公司，分公司所在地法院将具有优先管辖权。然而，原告不能仅凭此事实在该分公司所在地法院优先提起诉讼。即使业务发生在该分公司，原告仍需遵守相关规定，不能仅凭此事实在该分公司所在地法院优先起诉。