市、县级政府的监督管理责任

根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十四条规定，市、县级人民政府及其有关部门在征地拆迁过程中应依法加强对建设活动的监督管理。对于违反城乡规划进行建设的行为，应依法进行处理。

违章建筑的调查、认定和处理

在市、县级人民政府作出房屋征收决定之前，应组织有关部门对征收范围内未经登记的建筑进行调查、认定和处理。对于被认定为合法建筑和未超过批准期限的临时建筑，应给予补偿。对于被认定为违法建筑和超过批准期限的临时建筑，不予补偿。

拆除违章建筑的补偿问题

对于拆除违章建筑和超过批准期限的临时建筑，不予补偿。对于拆除未超过批准期限的临时建筑，应给予适当补偿。

违章建筑在征地拆迁中的处理原则

1. 合法建筑应纳入补偿范围

对于因历史原因合法建造的房屋，可依据《物权法》第30条取得物权，应完全纳入拆迁征收补偿范围。

2. 存量违章建筑的处理

对于在当事人无违法主观认识下客观上形成的存量违章建筑，如果在处罚时效内，按照《行政处罚法》第44条处理；如果超过处罚时效，按照《行政处罚法》第29条不予追究。基于已经稳定的社会关系，应完全纳入拆迁征收补偿范围。

3. 存量违章建筑责任分配

对于造成的存量违章建筑，当事人与政府均有过错。考虑到政府在行政管理关系中的强势地位，其过错程度应更高。在处理该类违章建筑时，应适当补偿，补偿比例可考虑在标准赔偿额的70%以上。

4. 政府默许下的违章建筑

对于在政府默许的状态下形成的违章建筑，政府应积极履责。如果在处罚时效内，当事人应承担政府默许的举证责任，完全纳入拆迁征收补偿范围。如果超过处罚时效，按照第一种情况完全纳入拆迁征收补偿范围。

5. 通过受让取得的违章建筑

对于通过受让取得他人违章建筑的情况，在具体认定和处理期间应从时间节点溯及至违章建筑的原占有人的建成时。如果在处罚时效内，应给予现违章建筑占有人以受让对价补偿，以填平补偿当事人的直接损失，使当事人遭受的损失降至最低。如果超过处罚时效，完全纳入拆迁征收补偿范围。

6. 棚户区的处理

对于棚户区，应本着实事求是的原则，采取适当补偿为宜。

7. 政府征收时违法吊销证照造成的违章建筑

当事人可以根据《行政诉讼法》第45条等规定要求补偿和赔偿。