瑕疵股权转让合同有效。但如果股权转让人隐瞒股权存在瑕疵的事实，股权受让人在订立合同时，对此不知或不应知道是，该瑕疵股权转让合同效力待定，当受让人申请撤销时，该合同无效，当受让人接收时，该合同有效。

法律依据

《《中华人民共和国民法典》》第六百一十八条   【减轻或者免除瑕疵担保责任的例外】当事人约定减轻或者免除出卖人对标的物瑕疵承担的责任，因出卖人故意或者重大过失不告知买受人标的物瑕疵的，出卖人无权主张减轻或者免除责任。