农村拆迁补偿款纠纷可以请求当地县级以上人民政府协调处理，协调双方未达成合意的可由批准征用土地的人民政府裁决，对裁决不服的可以依法申请行政复议或向人民法院提起行政诉讼。

法律依据

《《国有土地上房屋征收与补偿条例》》第二十五条   房屋征收部门与被征收人依照本条例的规定，就补偿方式、补偿金额和支付期限、用于产权调换房屋的地点和面积、搬迁费、临时安置费或者周转用房、停产停业损失、搬迁期限、过渡方式和过渡期限等事项，订立补偿协议。   补偿协议订立后，一方当事人不履行补偿协议约定的义务的，另一方当事人可以依法提起诉讼。