备案并非互换土地合同效力的必要要件

根据我国农村土地承包法规定，对于采取转包、出租、互换或其他方式流转的土地，应当向发包方备案。然而，备案只是一种行政管理手段，其性质仅仅是为了公示和管理，并不影响当事人的权利和义务，也不是合同生效的必要要件。因此，不能以未经备案为由否定互换土地协议的效力。

互换土地的耕种人已成为实际承包经营权人

根据当事人签订的互换田地协议，双方已经长期进行田地的互换，并对各自田地的承包经营权利义务进行调换。王某已经多年实际耕种所交换的土地，并未引起任何异议。因此，互换的田地承包经营主体已经发生了变化，不再是原来权利证书上载明的赵某。根据农村土地承包法规定，土地承包经营权流转的收益归承包方所有。因此，本案中的土地补偿费应归现在的耕种人王某所有。

维护农村土地流转稳定性的必要性

为了维护农村土地流转的稳定性，应确认互换土地的效力。农户之间进行土地互换是为了方便耕作，促进农业生产的发展，应该得到鼓励和支持。即使互换土地的农户未向村小组提出书面许可申请，甚至未签订书面协议，也应维护互换土地协议的效力。否则，土地流转的不稳定性将导致农业生产秩序混乱，并引发大量农村土地纠纷。

合同法的适用

从合同法的角度来看，合法自愿是订立合同的一项原则。依法订立的合同具有法律约束力。在本案中，双方当事人订立的互换土地协议符合法律规定的合法自愿要求，合同已经成立。因此，双方当事人应履行协议约定的义务并享受协议约定的权利。