处理过了诉讼时效的借贷纠纷的方式有，如果一方起诉，另一方未提出诉讼时效的抗辩权的，则法院仍可依法进行审理。或者由当事人自行达成和解来处理、以及由第三方进行调解来处理；。

法律依据

《《中华人民共和国民事诉讼法》》第一百二十二条   起诉必须符合下列条件：   （一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；   （二）有明确的被告；   （三）有具体的诉讼请求和事实、理由；   （四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。