双方协议离婚后子女抚养问题的法律依据

离婚后的父母子女关系

根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条规定，父母与子女间的关系在父母离婚后并不会消除。无论子女由父亲或母亲直接抚养，他们仍然是双方的子女。离婚后，父母仍然享有对子女进行抚养、教育和保护的权利和义务。

子女抚养原则

根据《中华人民共和国民法典》的规定，不满两周岁的子女原则上由母亲直接抚养。已满两周岁的子女，如果父母双方无法就抚养问题达成协议，人民法院会根据双方具体情况，并依照最有利于未成年子女的原则作出判决。而对于已满八周岁的子女，法院将尊重他们的真实意愿。

特殊情况下的抚养安排

然而，如果双方通过协议确认不满两周岁的子女由父亲直接抚养，并且这种安排对子女的健康成长没有不利影响，那么人民法院应当予以支持。这意味着，即使不满两周岁的子女本来应该由母亲直接抚养，但如果双方协议认为父亲更适合直接抚养子女且不会对子女的健康成长产生不利影响，法院会支持这种安排。

根据以上法律依据，离婚后的子女抚养问题应当根据子女的年龄和具体情况来确定。无论是由父亲还是母亲直接抚养，父母都有权利和义务对子女进行抚养、教育和保护。如果父母无法就抚养问题达成协议，人民法院将根据最有利于未成年子女的原则作出判决。然而，在特殊情况下，如果双方协议认为不满两周岁的子女由父亲直接抚养并且不会对子女的健康成长产生不利影响，法院将予以支持。