离婚有两个孩子的，抚养权的归属问题可以由双方进行协商；协商不成的，可以就抚养权问题向法院起诉，法院一般会将不满两周岁的孩子判给母亲，让母亲抚养孩子；八周岁以上的孩子，法院会在询问过孩子的意愿的情况下，将孩子判给他愿意随之生活的一方。

法律依据

《民法典》第一千零八十四条 父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。 离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。 离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。