夫妻分居三年了能离婚。法律规定，夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。工作人员审查后，认为双方符合离婚条件，待其度过冷静期后，依法为其办理离婚登记手续。

法律依据

《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条   夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。   离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。

《中华人民共和国民法典》第一千零八十条   完成离婚登记，或者离婚判决书、调解书生效，即解除婚姻关系。