一、没收财产的限制

根据《刑法》规定，没收财产仅限于对犯罪分子个人所有财产的部分或全部进行没收。与案件无关的财产不得被没收。犯罪分子配偶的房产不在没收范围内，因为这些财产属于配偶个人所有，我国法律保护公民合法财产的权益。

二、法院执行没收财产处罚时的注意事项

1. 没收财产的范围：法院只能没收判决书规定的财产，一般情况下是犯罪分子个人的财产。2. 保留被扶养人和犯罪分子的生活所需：法院在执行没收财产处罚时，应当保留被扶养人和犯罪分子的基本生活需求，例如唯一的房屋不得被没收。3. 债务偿还优先：如果犯罪分子存在合法债务，当债权人提出偿还债务请求时，犯罪分子的财产应优先用于偿还债务，偿还债务后的剩余财产才能进行没收。综上所述，犯罪分子配偶通过合法途径取得的房产受到法律保护。在法院判处没收财产的情况下，不能将犯罪分子配偶的房屋纳入没收范围。