不能办理协议离婚的情形： 1、未订立书面离婚协议书； 2、双方不能就自愿离婚、子女抚养、财产、债务等相关事项协商一致； 3、当事人不具备完全民事行为能力； 4、其结婚登记不是在中国内地办理的； 5、其他情形。

法律依据

《《婚姻登记条例》》第十二条   办理离婚登记的当事人有下列情形之一的，婚姻登记机关不予受理：   （一）未达成离婚协议的；   （二）属于无民事行为能力人或者限制民事行为能力人的；   （三）其结婚登记不是在中国内地办理的。