茂名老家合法申请盖5层楼房，但只盖了两层

茂名的宅基地建房规定明确禁止超面积建设，而根据中国相关法律规定，超建房屋将面临罚款，并且罚款计算可能涉及整栋楼面积。

在茂名地区，农村宅基地和农房建设的管控是非常严格的。据《茂名市农村宅基地和农房建设管控实施意见（试行）》所示，该地区实行“一户一宅”政策，并对建房的审批原则、程序有着详细的规定。此外，还特别强调了节约用地的重要性，对不同地区的宅基地用地面积均设有上限标准。

针对超建房屋的情况，中国的相关法规如《土地管理法》等都有明确规定。违法建筑的认定依据包括《城乡规划法》、《土地管理法》及其实施条例等。一旦房屋被认定为违法建筑，可能需退还非法占用的土地，并限期拆除在非法占用土地上新建的房屋。至于罚款的具体计算，则会根据实际超建的层数或面积来决定，有案例显示，罚款计算会考虑实际超建的建筑面积。如果同一违法行为触及多个法律规范，原则上应按照罚款数额最高的规定来进行处罚。

对于您的具体情况，即在茂名老家合法申请盖5层楼房但只盖了两层，且宅基地批40平方面积而实际做了85平方面积，根据上述法律规定，这显然属于超建。您需要做的是：

立即停止任何进一步的建设工作；
尽快联系当地农业农村局或自然资源部门了解具体的处罚标准和程序；
根据官方指导，考虑调整现有建筑至合法状态或者申请相应的合法扩建手续；
如果已经收到行政处罚通知，那么应该按照通知要求进行整改，并支付可能规定的罚款。
建议您积极配合政府部门的管理，按照规定办理相关手续，以免受到更为严重的行政处罚。同时，也要注意后续的建筑安全和合法性，确保符合当地的规划和建筑法规要求。