两村的耕地边界确权有纠纷怎么解决

双方应首先尝试通过友好协商的方式解决争议。在协商过程中，双方可以共同查看土地权属证明文件，如土地承包经营权证、土地使用权证等，以便更清晰地了解各自的权益范围。
请求调解：如果协商无法达成一致意见，双方可以请求村民委员会或乡（镇）人民政府进行调解。基层组织通常对当地的实际情况有较为深入的了解，他们的介入可能有助于找到一个双方都能接受的解决方案。
政府处理：若调解仍未能解决问题，根据《中华人民共和国土地管理法》第十四条的规定，土地所有权和使用权争议应由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。
法律途径：如果以上所有努力都未能取得预期效果，双方可以考虑通过法院提起诉讼，让法院依照法律程序作出公正的裁决。
此外，还可以考虑利用现代科技手段，如无人机测绘等，来辅助确定争议地块的边界，以提高解决效率和准确性。