著作权诉讼中涉及多个不同地区被告的处理方式

根据《最高人民法院关于审理著作权民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》第五条规定，当著作权纠纷中涉及多个被告且不在同一地区时，原告可以选择其中一个被告的侵权行为实施地的人民法院来管辖。

共同诉讼的情况下

在涉及不同侵权行为实施地的多个被告被提起共同诉讼的情况下，原告可以选择其中一个被告的侵权行为实施地的人民法院来管辖。

单独诉讼的情况下

在仅对其中某一被告提起诉讼的情况下，该被告侵权行为实施地的人民法院有管辖权。

著作权侵权诉讼中的举证问题

在著作权侵权诉讼中，一般采用谁主张谁举证的原则。然而，在实际情况下，原告很难获得被告软件的源程序，即使原告申请法院调查收集证据，被告也会拒绝提供其软件源程序。在这种情况下，如果原告能够证明双方软件的目标程序相同或实质性相似，或者虽然不相同或实质性相似，但被告软件的目标程序中存在原告软件中的特有内容，或者双方软件的运行界面相同，那么可以认定原告已经完成了相应的举证责任。

侵权行为的证据

侵权行为的证据是最重要的。司法实践中一般采用“实质性相似加接触原则”，即需要提供证据证明原告软件和被告软件是相同的或构成实质性相似，并且被告接触了或有可能接触了原告的软件，才能初步认定侵权行为的存在。

以下是侵权行为的证据：

1. 原告软件的程序和文档；
2. 被告软件的程序和文档；
3. 原告软件和被告软件的程序和文档经过比对后相同或实质性相似的证据。建议申请知识产权司法鉴定机构进行司法鉴定，因为鉴定结论的证明力通常大于其他书证、视听资料和证人证言，证明力较高；
4. 被告接触了原告软件的程序和文档，只要能证明存在接触的可能性即可。例如，原告的软件开发人员跳槽到被告单位工作。

上述程序和文档主要指相应软件的源程序和与源程序开发相关的开发文档。